航拍國家基因庫。 深圳國家基因庫 供圖
中國網(wǎng)22日深圳訊(記者 戴凡 張若夢)9月22日上午, 深圳國家基因庫舉行啟動儀式,標志著我國首個、也是唯一一個獲批籌建的國家基因庫正式運營。
據(jù)國家基因庫執(zhí)行主任徐訊介紹,此次宣布啟動的國家基因庫數(shù)字化平臺裝備了150臺BGISEQ-500型測序儀和1臺RevolocityTM測序儀,目前總數(shù)據(jù)產(chǎn)量將達到每年5Pb,相當于一年5萬人全基因組或是1000萬產(chǎn)前篩查的數(shù)據(jù)產(chǎn)出規(guī)模,升級后的系統(tǒng)預(yù)計年產(chǎn)數(shù)據(jù)可達10Pb,將成為全球最大的數(shù)據(jù)產(chǎn)出平臺。同時,宣布啟動的國家基因庫開放數(shù)據(jù)中心,已經(jīng)建成了20Pb數(shù)據(jù)的可訪問能力,并規(guī)劃在二期完成500Pb的可訪問能力,能力上超越國際三大基因數(shù)據(jù)中心,填補了我國長期缺少國家級基因數(shù)據(jù)中心的空白。該數(shù)據(jù)中心首批將對公眾開放1Pb的非冗余數(shù)據(jù)的檢索和比對服務(wù),涵蓋罕見病、癌癥、腸道菌群、農(nóng)業(yè)、物種多樣性等13個高質(zhì)量的數(shù)據(jù)庫,將大大促進全球生命科學(xué)領(lǐng)域的進步,在疾病診斷和治療、農(nóng)業(yè)新資源的開發(fā)和利用、物種和生態(tài)多樣性保護等基因相關(guān)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展中也將起到重要的推動作用。
深圳國家基因庫主任梅永紅表示,國家基因庫將繼續(xù)以服務(wù)國家戰(zhàn)略需求作為出發(fā)點,融合近年來生命科學(xué)學(xué)科的國際前沿動向,進一步完善 “三庫兩平臺”的業(yè)務(wù)結(jié)構(gòu),扮演好公共服務(wù)平臺的角色,形成從資源到科研、產(chǎn)業(yè)的全貫穿全覆蓋的模式,實現(xiàn)大資源、大數(shù)據(jù)、大科學(xué)、大產(chǎn)業(yè)的聯(lián)動。
據(jù)了解,國家基因庫基地位于深圳市大鵬新區(qū)大鵬街道下沙片區(qū)“禾塘仔”地塊,分兩期建設(shè)。目前,一期建筑面積47500平方米已經(jīng)全部完工,建筑融合了梯田、山石、桃花源的設(shè)計理念和生態(tài)、生產(chǎn)、生活融合的運維原則,是一個層層梯田種植屋面、混泥土本色與垂直綠化相結(jié)合的低碳生態(tài)建筑。
在業(yè)務(wù)和功能建設(shè)方面,深圳國家基因庫已經(jīng)初步建成了“三庫兩平臺”的功能和結(jié)構(gòu),包括生物資源樣本庫(濕庫)、生物信息數(shù)據(jù)庫(干庫)、生物活體庫(活庫)及數(shù)字化平臺(讀平臺)、合成及編輯平臺(寫平臺)。其中,樣本庫已儲存樣本超過1000萬份;信息庫建成十余數(shù)據(jù)庫、統(tǒng)一檢索系統(tǒng)及強有力的數(shù)據(jù)傳輸、云計算等支撐實力; 數(shù)字化平臺年產(chǎn)數(shù)據(jù)5Pb以上;合成與編輯平臺,啟動超高通量、超低成本的基因組合成與編輯產(chǎn)能的規(guī)劃和部署;活體庫致力于保護和保存世界約三十萬種植物、百萬種動物、近千萬種微生物活體資源,并已啟動瑞麗植物園數(shù)字化項目,促進資源數(shù)字化和多組學(xué)研究,實踐其創(chuàng)新性應(yīng)用。